Систем самопречишћавања се односи на систем који има одређени степен самопречишћавања и способност апсорпције загађивача животне средине. То је агроеколошки комплекс у коме се загађивачи животне средине самопречишћавају под претпоставком да не прелазе еколошки капацитет кроз физичке, хемијске и биолошке ефекте пољопривредног земљишта, биљака и микроорганизама.
