На крају леденог доба, нилски коњи су били широко распрострањени у Северној Америци и Европи. У то време су нилски коњи могли преживети у хладној клими.
Порекло: Ангола, Бенин, Боцвана, Буркина Фасо, Бурунди, Камерун, Централноафричка Република, Чад, Конго, Демократска Република Конго, Обала Слоноваче, Екваторијална Гвинеја, Етиопија, Габон, Гамбија, Гана, Гвинеја, Гвинеја Бисау Кенија, Либерија, Малави, Мали, Мозамбик, Намибија, Нигер, Нигерија, Руанда, Сенегал, Сијера Леоне, Сомалија, Јужна Африка, Судан, Свазиленд, Уједињена Република Танзанија, Того, Уганда, Замбија, Зимбабве.
Изумирање: Алжир, Египат, Еритреја, Либерија, Мауританија.
Углавном живе у Националном парку Арусха, Националном парку Лаке Маниара, Националном парку Микуми, Природном резервату афричке владине организације, Националном парку Руаха.