Већина ћелија је врло мала, изван граница људског вида. За посматрање ћелија мора се користити микроскоп. Међутим, док се не препозна објективно постојање ћелија, још увек је немогуће знати да су објекти посматрани под микроскопом ћелије. Тако је 1677. године, када је А. ван Лееувенхоек посматрао животињски ГГ куот; сперму ГГ куот; са једноставним микроскопом који је направио, није ГГ # 39; не зна да је то била ћелија. Реч ћелија (изведена из латинског целла, што првобитно значи празна, ћелија) добила је име по Р. Хоокер-у када је 1667. године посматрао пресек плуте, у виду плуте садрже мале ћелије. Заправо, ове ћелије нису живе структуре настале од ћелијских зидова, али се из тог разлога користи израз ћелија. У просветитељском периоду цитологије, иако се многи мали предмети - попут бактерија и цилијација - такође посматрају једноставним микроскопом, главна сврха је посматрање неких развојних феномена, попут метаморфозе лептира, структуре сперме и јајних ћелија. Због тадашњих ограничења микроскопа, нетачности запажања и ограничења верских уверења, ова запажања су заправо подржавала догму теорије пре-естаблишмента. Неки људи тврде да су видели специфичне и суптилне ГГ куот; мале човечиће ГГ; у сперми и верују да ће се они развити у будуће појединце - есенцијалисте; други верују да ГГ куот; мали људи ГГ куот; постоје у јајима --- јајашци. Утицај предрасуда трајао је више од 100 година, ометајући људе у даљем разумевању ћелија на основу Р.Хоокера. Тек 1827. године К.М. Белл је открио јаја сисара која је почео пажљиво да посматра саме ћелије. Ахроматска сочива сочива развила су се пре и после овога, увођење кармина и хематоксилина као боје за бојење језгра и покретање микротома и технологија сечења створили су повољне услове за детаљније посматрање ћелија.
